DeepMind 用 AI 智慧體篩出抗菌肽候選並進入溼實驗
Google DeepMind 10 月 15 日發布技術演示,展示用 AI 開發平台 Google Antigravity 的智慧體尋找抗菌肽:從 UniProt 數百萬條序列出發,經 ProtNLM 功能預測與序列、AlphaFold 結構、基因組鄰域三類證據篩選,找到一種 97 個胺基酸的乳酸菌素 972 家族細菌素候選(UniProt A0A0U0D591),已進入溼實驗驗證。
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Google DeepMind 10 月 15 日發布技術演示,展示用 AI 開發平台 Google Antigravity 的智慧體尋找抗菌肽:從 UniProt 數百萬條序列出發,經 ProtNLM 功能預測與序列、AlphaFold 結構、基因組鄰域三類證據篩選,找到一種 97 個胺基酸的乳酸菌素 972 家族細菌素候選(UniProt A0A0U0D591),已進入溼實驗驗證。
Google DeepMind 發布一種可充當數字身份證的水印,用於標記 AI 生成的合成蛋白質。該水印能幫助 DNA 實驗室核驗合成蛋白來源,並保持序列資料庫的準確性。隨著相關需求規模擴大,驗證設計是否來自帶內建防護的 AI,將有助於實驗室實現自動化並加強生物安全。
Google DeepMind 發布 SynthID Bio,一套面向 AI 生成生物設計的水印方法。官方稱這是全球首次能在不影響生物功能的前提下,把不可感知的簽名直接嵌入蛋白質序列。該技術屬於 SynthID 水印體系的新分支,具體覆蓋範圍、檢測方式與可用時間尚未公布。
研究者用 AI 蛋白設計工具,只保留兩類蛋白酶的催化核心、替換其餘全部結構,得到能把特定蛋白定向切成兩半的人工酶。天然肽鍵極為穩定,估計半衰期長達數百年,生物靠演化出的多種蛋白酶來催化其斷裂,這項工作是跳過自然演化過程直接重設計酶。團隊用它們切割與神經疾病相關的蛋白,驗證了有效性。
Google 的智慧體開發平台 Antigravity 跑通了一次抗菌肽發現流程,在 Streptococcus pseudopneumoniae 中找到一條 97 個胺基酸的細菌素候選物,預測對呼吸道感染相關病原體有活性,目前已進入溼實驗驗證。Antigravity 把跨資料庫檢索、三維結構分析與文獻綜合收進一個會話,並呼叫 ProtNLM 直接從胺基酸序列預測功能,為 UniProt 中數百萬條未註釋序列補上功能標籤。
MiniMax 正式發布 M3.1 Flash,官方稱其在 agentic 任務、coding、Computer Use 與網路安全上全面提升,使用成本較上一代降低 70%,線上推理速度提升近 3 倍。定價為每百萬 tokens 輸入 0.15 美元、輸出 0.60 美元、快取輸入 0.015 美元,日常輸出可達 200+ TPS(P50 170+ TPS)。
華盛頓大學大衛·貝克團隊聯合新加坡國立大學提出文字條件化全原子蛋白質結構生成模型 Prompteina,用自然語言提示即可指定蛋白質的結構與功能特性。團隊同時建置了含 180 萬個結構、超 5000 萬條說明文字的 Prompteina-Data 資料集。在 18 項結構特性基準中 Prompteina 有 15 項領先基線,智慧體引導的結合體設計介面置信度比最強基線提高 14%;針對此前無已報導從頭設計結合體的 GM2A,90 個測試設計中有 9 個產生結合體。
一篇新論文提出 Minions:把多臺 macOS 裝置上閒置的 Apple Silicon GPU 聚合成分散式虛擬 GPU 雲,用來跑大規模機器學習推理。作者認為集中式 GPU 基礎設施成本高、彈性有限、資源緊張時等待時間長,而 Apple Silicon 裝置的 GPU 在日常使用中大多處於空閒狀態。論文稱該方案讓團隊能夠利用現有裝置承載推理負載,具體排程方式與效能資料未在摘要中給出。
Google DeepMind 宣布,四個 Gemini 4 Argon 智慧體從零開始,在 27 小時內通關 Minecraft,全程沒有任何人類幫助。它們在沙盒環境中僅使用程式碼和文字操作,一共編寫了 2783 個程式,通過聊天分配各自的任務、共享筆記,並一起除錯出現的錯誤。
Google DeepMind、Meta 與 AI 製藥公司 Isomorphic Labs 共同出資 3 億美元,投入由扎克伯格夫婦創立的非營利生物醫學機構 Biohub 牽頭的“虛擬細胞”專案。該專案屬於總額 18 億美元的“Virtual Biology”計劃,目標是建置可供 AI 使用的生物資料集與高精度預測模型,讓研究者能以數字化方式提出、預測並回答生物學問題,用於對抗疾病。Biohub 成立於 2016 年,長期以預測模型推動疾病防治研究。
Leash Bio 發布 Minos——一個讓 AI 智慧體進行可驗證科學推理的測試環境,同時公開預印本、部落格與開放資料集。其 DNA 編碼庫(DEL)多年積累的資料可提供數萬條「lab-in-the-loop」模擬,正好用作科學強化學習環境。在該沙盒中,LLM 需用自然語言推理構效關係,在 650 萬分子中、以 100 次預算找出最佳結合物。團隊自研的 Hermes 僅用自家資料訓練,在公開基準上與 Boltz 相當。
Google DeepMind 的 Pushmeet Kohli 與 Biohub 的 Sal Candido 在對談中表示,AlphaFold 的突破只是開始,蛋白質摺疊問題遠未解決。兩人認為僅擴大算力與資料不足以解決生物學問題,關鍵是先找到合適的 scaling law,低品質宏基因組資料也能提升蛋白質語言模型;建置虛擬細胞需要根本不同的資料集,研究須從單個蛋白質走向整個生物系統,治癒所有疾病要靠 10x 級突破而非漸進改進。
金融時報發布文章 How Protein Took over the World,中文意為「蛋白質如何統治世界」。該連結隨後被分享到 Hacker News,目前獲得 9 分、7 條評論。本條資料只提供原文連結與討論入口,未包含文章正文內容。
Google DeepMind 發布了一套可快速驗證生物設計是否內建安全防護的工具,並以開放形式供研究使用。該工具面向科研人員,目的是在 AI 加速科學發現的同時不拖慢關鍵研究進度。官方未披露具體工具名稱、技術細節與適用限制。
Anthropic 公布,211 個候選中有 17 個達到結合體(binder)標準。這些結合體能結合墨西哥、北非和中東的蠍子所產生的危險毒素,但對巴西一個物種的毒素不產生結合。帖文未說明這些候選的設計方法與篩選實驗條件。
Nikon 認定清華大學徐寧的 Small World in Motion 參賽影片使用 AI、不符合比賽規則,取消其冠軍資格,新科第一為越南的 Nguyen Nam Nhat,作品拍攝微小線蟲與單細胞生物。據 BBC 報導,有研究者指出該影片存在結構異常、細胞特徵憑空出現和消失,原始檔中還發現疑似 AI 水印;徐寧稱 AI 僅用於區分與視覺化重建灰度影像中的特徵,否認用它生成實驗影像、纖毛及其運動。
llama.cpp 建置 b11551 新增 MiniCPM-V 4.7 多模態模型支援,mtmd 與 conversion/minicpm.py 轉換指令碼同步更新。同時允許 mrope 的時間從額外位置槽讀取,GGUF 新增 rope.section_order 後設資料,並處理 grid layout 與相容性問題。
Anthropic 讓 Claude Science 中的內部研究模型設計針對蠍子神經毒素的 minibinder,64 小時內生成 31.8 萬個設計,並從中選出 180 個送檢。加上團隊補充的 31 個,Adaptyv Bio 與 Twist Bioscience 共實驗室測試 211 個設計,其中 17 個滿足結合標準,分別針對四種對人類危險的蠍毒。
面壁智慧與 OpenBMB 開源 MiniCPM-V 4.7,其中 35B-A3B 是 MiniCPM-V 系列首個 MoE 模型,約 3G 記憶體就能在 iOS、安卓裝置上流暢執行,iPhone 17 Pro Max 上解碼速度超過每秒 13 個 token。另有實際引數 1.3B 的 1B 版本,主打 OCR、數學與影片理解。
Anthropic 將 211 個經過測試的蠍毒素結合蛋白(scorpion toxin binder)設計連同實驗室資料一併公開,作為科研人員可用的資源。資料集已發布在 Hugging Face 的 Anthropic/scorpion-toxin-binder-design 頁面,完整技術報告以 PDF 形式同步釋出,包含設計細節與實驗說明。