分子之心 MMDesign 報告：19 個專案成功率 94.7%，六個 GPCR 靶點全命中
分子之心發布 MMDesign 技術報告：19 個設計專案中 18 個獲得實驗確認的結合分子，專案成功率達 94.7%，每個專案只測試 9—50 個候選，中位數 21 個。六個 GPCR 靶點全部命中，其中 NK3R 的 30 個候選全中，GPR68 的 11 個候選命中 10 個，最佳親和力 KD 達 12.1 nM。對六個已有成果靶點的新一輪設計中五個實現提升，如 PDGFR 候選命中率從 4.0% 升至 21.1%；兩項大環肽設計同樣獲得結合分子。
94.7% 專案成功率、單個專案最少只測 9 個候選、六個 GPCR 靶點全命中，並給出 MMFold 約為 AlphaFold 3 兩倍的結構預測資料，為 AI 製藥的可重複工作流提供了可核查的實測數字。
原標題：从单点突破到系统性验证：分子之心MMDesign实现94.7%项目成功率、六大GPCR靶点全获命中
閱讀原文
| 評分 | 72 / 70（平均 71，門檻 65） |
|---|---|
| 狀態 | 精選 |
相關報導
Claude 64 小時生成 31.8 萬種蛋白設計，17 種通過實驗驗證
Anthropic 公布：Claude 在 64 小時內生成 318484 種微型結合蛋白設計，針對 5 種蠍毒神經毒素，最終 17 個在實驗室達到結合標準。團隊從這批設計中挑出 211 個，交由 Adaptyv Bio 與 Twist Bioscience 驗證；其中 7 個結合 Cn2，兩個候選的解離常數達個位數納摩爾，但尚未驗證中和毒素或動物體內保護。
GPT-Rosalind 用 32 分鐘找出神經退行性疾病新線索
OpenAI 的 GPT-Rosalind 在 Perry 綜合徵相關基因 DCTN1 的小鼠腦資料中發現藥物研發新線索：膽固醇可能無法運到神經元需要的位置，進而引發退化。數千個 agent 並行工作，僅用 32 分鐘就把數百萬個小鼠腦細胞基因表達結果與科學文獻關聯起來，合作方為 PerturbAI 與 Scripps Research。雙方正擴大合作，繼續尋找新藥靶點。
Gemini 4 Argon 數小時設計出 5 種活性絲胺酸酯酶
Gemini 4 Argon 在數小時內完成絲胺酸酯酶的設計與篩選，產出 5 個全新設計，後續實驗室測試證實它們均具備穩定的催化活性。研究人員以 4MU-acetate 為基準分子，該分子酯鍵被切開後會在紫外光下發光；Argon 負責彙總相關資料、進行模型微調並給出一系列生物化學篩選條件。傳統酶工程常需數月的模型調優與候選篩選，這一流程有望加速生物製造、綠色化學與藥物研發。
ETH 與羅氏用主動學習結合幾何圖神經網路預測硼化反應位點
蘇黎世聯邦理工學院（ETH）與羅氏團隊在《Nature Computational Science》發表研究，把主動學習與幾何圖神經網路串成閉環，預測藥物分子 C–H 硼化反應能否發生、發生在哪個位點。模型從 518 種底物、2044 組高通量實驗資料起步，先用 XGBoost 判斷反應是否成功，再以 BALD 採集函式從羅氏 22,253 種芳香族化合物中挑樣做實驗；三輪共新增 50 種底物、4821 組結果，總計 6865 組，覆蓋 568 種底物。